Era companheiro de time de Hatake Kakashi e Rin, alunos do futuro Yondaime Hokage(quarto hokage) . Não se dava bem nas lutas, sempre chegava atrasado, dando desculpas esfarrapadas, não conseguia usar o Sharingan ainda, gostava de Rin, que gostava de Kakashi, e sempre recebia bronca de Kakashi, o que o levava a odiá-lo.

No dia em que Kakashi virou jounin, Obito não deu nenhum presente para ele. Rin, Kakashi e ele foram destruir uma ponte no país da Pedra. No meio do caminho, Rin foi sequestrada. Kakashi disse que eles deveriam seguir a missão normalmente, já que um ninja deve primeiro seguir as regras, mas Obito disse que um ninja deve sim seguir as regras, mas aquele que não se importa com seus companheiros é o pior lixo que existe, e segue para resgatar Rin. Kakashi entendeu o que ele quis dizer e foi ajudá-lo. Kakashi salva Obito, machucando seu olho esquerdo. Para salvar seu amigo, Obito desperta seu Sharingan. Eles conseguem resgatar a Rin, mas um ninja faz várias pedras despencarem. Uma delas cai em Kakashi, que havia perdido um olho, o esquerdo, o impossibilitando de esquivar. Para salvá-lo, Obito o empurra, e várias pedras o esmagam. Com apenas parte de seu corpo do lado de fora,em um ato de muita bravura, pede que Rin passe seu Sharingan para Kakashi, como presente. Mais pedras caem, e Obito morre embaixo delas.